A obra traz perguntas feitas por crianças e adolescentes sobre a origem da vida, o desenvolvimento do corpo, as diferenças entre as pessoas e o modo como elas se relacionam afetiva e sexualmente. O livro é uma produção do projeto de extensão Universidade das Crianças, da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). As perguntas foram depositadas em urnas deixadas em escolas públicas de educação básica de Minas Gerais. Professores e alunos da UFMG, de diferentes áreas do conhecimento, elaboraram as respostas. Estudantes de Belas Artes criaram o projeto gráfico e as ilustrações, usando o humor como recurso para tornar o livro atraente. O título Que cegonha o quê! indica que a proposta da obra não é falar de cegonhas, ou seja, de histórias inventadas, baseadas na crença de que as crianças não estão preparadas para saber sobre a sexualidade e o desenvolvimento do corpo.