Shinji Ikari, um jovem de 14 anos carente de afeto e desprovido de amor-próprio, de repente, é chamado por seu pai com quem nunca teve contato a comparecer à NERV para pilotar bio-robôs de combate, gigantes os EVAS e assim salvar o mundo de misteriosos seres denominados Anjos, os quais ninguém sabe ao certo se são enviados de Deus para castigar a humanidade ou alienígenas invasores.