O objetivo do livro de Jonas é ilustrar o tema da misericórdia de Javé, mostrando que ele não é um Deus nacional, mas o Deus de toda a humanidade também é um Deus imprevisível que muda suas decisões a partir das decisões do próprio homem. Acima de tudo, ele é o Deus da vida e quer que todos se convertam para ter vida. O desafio do livro é se nós estamos dispostos a aceitar um Deus com essas características, o que implicaria em também nós termos o mesmo comportamento que ele.