Marcos Duprat teve formação artística em cursos de desenho e pintura na Escola Nacional de Belas Artes, no atelier do Museu de Arte Moderna do Rio de Janeiro, na Universidade de Waseda em Tóquio e de 1974 a 1977, obteve o Mestrado em Belas Artes com especialização e tese em pintura na The American University, em Washington, D.C.