Nunnally é uma ex-princesa que teve sua mãe assassinada pelo Sacroimpério da Britannia e foi privada da visão e do movimento das pernas. A garota vive amparada por seu irmão mais velho, Lelouch, a quem ama muito. Porém, até mesmo seu irmão será tomado de Nunnally, após um ataque de soldados do Império. Com o choque, a garota entra em contato com Nemo, um recipiente sobrenatural, e desperta um poderoso Geass, que lhe concede a habilidade de prever o futuro e de pilotar um Knightmare Frame, poderosos robôs de batalha. Assim, começa o "pesadelo" de Nunnally em busca da vingança contra a Britannia!