Rintaro Okabe é o autoproclamado “mad scientist maluco”, que acredita ser perseguido pela “Organização”. Ele é líder do laboratório Mirai Gadget, que, até o momento, só tem três membros e umas invenções bizarras. Porém, um desses inventos acaba funcionando como uma “máquina do tempo”, e as consequências de seu uso são imprevisíveis!