A cavidade bucal é um ecossistema complexo e altamente diversificado. Muito além da presença de superfícies dentárias e superfícies mucosas constante¬mente banhadas por saliva, o ambiente bucal abriga uma vasta diversidade de microrganismos, como bactérias, fungos, arqueias, protozoários e vírus.  Esses microrganismos estão em constante interação uns com os outros e com o seu hospedeiro em uma relação que normalmente é compatível com saúde bucal.  Entretanto, determinados fatores podem promover a transição da microbiota para um estado de disbiose possibilitando o desenvolvimento de doenças, dentre elas, cárie dentária, doenças periodontais e peri-implantares, infecções endodônticas e infecções fúngicas.  Dessa forma, é necessário compreender os mecanismos e processos dinâmicos responsáveis pela manutenção da saúde bucal e pela transição de condição de saúde para uma condição de doença.