Quando foi escolhida para sediar a primeira embaixada portuguesa especialmente projetada e construída para tal fim, na década de 1950, a cidade do Rio de Janeiro ainda era capital da República. Visando reverenciar e comemorar as relações fraternas de Portugal e Brasil à altura da sua história que já conta mais de cinco séculos, foi planejado o Palácio de São Clemente uma vitrine de excelência portuguesa no Brasil.