No Projeto Radix - Ciências, todos os volumes são compostos de oito módulos que se dividem em um ou mais temas ou capítulos dependendo do conteúdo de cada assunto abordado, levando-se em consideração o tempo de aula, o que permite ao (à) professor (a) encerrar um assunto com um conjunto de atividades.
Em ciências os oito módulos independentes estão reunidos dentro do tema mais geral de cada volume (5ª série: Nosso ambiente; 6ª série: Os seres vivos; 7ª série: O corpo humano; 8ª série: Energia, matéria e ambiente).
O assunto principal de cada módulo subordina dois ou mais temas. Os títulos desses temas aparecem obrigatoriamente no início de uma página, nunca no meio delas, o que permite visualizar com clareza a hierarquia dos assuntos.