A História Secreta dos Papas mostra como um número impressionante de sumos sacerdotes da Igreja Católica agiu de forma totalmente contrária aos ensinamentos cristãos. Durante a Idade Média não faltaram papas que foram especialistas em conspirações, assassinatos e até bruxarias. O livro conta algumas das histórias mais assustadoras do Vaticano. Uma delas é o
Sínodo do Cadáver, em que o bondoso - e falecido - papa Formoso foi desenterrado, julgado por seu sucessor Estevão VII e jogado no Rio Tibre.
Outro pontífice foi particularmente vergonhoso para a Igreja Católica: João XII castrou um de seus cardeais, cegou outro e chegou a brindar ao demônio em um de seus bacanais. "A História Secreta dos Papas" também conta com detalhes como funcionou a sanguinária Inquisição e conta a história de algumas das suas mais célebres vítimas, como Galileu Galilei, que só escapou da morte porque foi obrigado a negar publicamente seus ideais. Mesmo assim,
o cientista viveu em prisão domiciliar e morreu melancolicamente.