'Padre Pio sob investigação - a 'autobiografia' secreta' é um livro sobre a vida de um santo. A obra é dividida em três partes, inicia-se com o prefácio de Vittorio Messori, que situa e contextualiza a publicação e sua importância. Na primeira parte, o autor traz um resumo dos fatos e da vida de Padre Pio, descrevendo não só as etapas da vida (infância, juventude, ingresso na vida religiosa) como os dons e graças do capuchinho. Na segunda, são transcritos os textos da investigação de Dom Raffaello Carlo Rossi. Inicia-se com considerações pessoais do visitador e, na sequência, é feita transcrição dos depoimentos das pessoas que se relacionavam mais proximamente com Padre Pio. Há cinco depoimentos do próprio Padre Pio, relatando estigmas, bem como de sua vida cotidiana no convento. Na terceira parte, são apresentados alguns textos como a própria Cronistoria di P. Pio, feita por um dos diretores espirituais de Pe. Pio, o Padre Benedetto Nardella de San Marco in Lamis.