Visando a regulamentação dos dispositivos introduzidos pela Emenda Constitucional nº 42, em 25 de março de 2004, a FENAFISCO formou uma Comissão de Trabalho, constituída de representantes dos sindicatos filiados dos Estados de Bahia, Ceará, Mato Gros so do Sul, Paraíba, Pernambuco, Rio de Janeiro, Santa Catarina e São Paulo , que ficou encarregada de formatar anteprojeto de Lei Orgânica da Administração Tributária Nacional. No decorrer dos trabalhos, a Diretoria da FENAFISCO propôs ao Conselho D e liberativo desta Entidade, a contratação de vários pareceres jurídicos a respeito da Nova Administração Tributária, inclusive, respondendo a quesitos previamente elaborados, o que originou o livro PARECERES. Em 2016, a luta pela aprovação da LOAT l ev ou a federação a apoiar financeiramente a edição do Manual de Administração Tributária, pelo Centro Interamericano de Administração Tributária CIAT, em português.