Afonso Taunay foi o mais importante historiador da cidade de São Paulo; planejou e realizou, quase integralmente, um plano ambicioso de escrita da história da cidade que dividiu em séculos. A Coleção São Paulo inicia a re-edição de suas obras com o volume referente ao século XVI, reunindo as duas obras do autor sobre o período. São Paulo nos Primeiros Anos narra, com certo humor, a vida precária e difícil que levaram os primeiros moradores da vila estabelecida no planalto, baseando-se no que ficou registrado nas Atas da Câmara Municipal. O livro oferece um quadro contundente da aventura enfrentada pelos primeiros colonizadores a se estabelecer no sertão do Brasil. São Paulo no Século XVI, baseado nos relatos dos jesuítas, volta-se para a dimensão trágica do estabelecimento da Vila de Piratininga, representada pela escravização dos índios e pelo empenho obstinado destes em destruir a vila e expulsar os colonizadores de seu território. Ao mesmo tempo ocorria uma ampla miscigenação e a catequese empreendida pelos jesuítas prosseguia com vitórias e derrotas.