Estruturado como um romance policial 'Akhenaton, o rei herege' é uma espécie de expedição arqueológica cujo objetivo é trazer à tona as verdades de um dos períodos mais turvos da história egípcia. À frente dessas escavações literárias está o jovem Miri-Mon, que resolveu entrevistar cada um dos personagens envolvidos naquela conspiração e fazer 'como a História, que escuta tudo o que se fala e não se curva a ninguém, para entregar a pura verdade àqueles que a observam".